Со стороны Украины в уставной капитал компании был передан сам НПЗ, со стороны Татарстана — акции добывающих компаний и денежные средства. Однако в 2007 году Татарстан, который вместе с «Татнефтью» контролировал 55,7% акций «Укртатнафты», потерял контроль над компанией, а в 2009 году по решениям украинских судов российская доля в предприятии сократилась до нуля.

Спорное арбитражное разбирательство между Украиной и «Татнефтью» рассматривалось в Москве, Нью-Йорке, Вашингтоне, Париже и Лондоне. В 2014 году арбитражная комиссия обязала ответчика выплатить «Татнефти» $112 млн компенсации. Федеральный суд в Вашингтоне подтвердил это решение, начислил проценты и вынес решение на сумму $173 млн. В декабре решение было подтверждено.