Июньская редакция 2009 нового Top500 самых мощных компьютеров мира, в очередной раз и безоговорочно признала победу Linux. На 443(88.6%) суперЭВМ списка установлен Linux, 22(4.4%) на Unix, 1(0.2%) суперЭВМ на BSD и 29(5.8%) смешанного типа операционные системы. И только 5(1%) суперкомпьютеров используют Windows, точнее Windows HPC 2008. Linux увеличил свою долю по сравнению с предыдущей редакцией списка на 4 компьютера. Количество компьютеров, работающих на Windows, осталось неизменным. Единственный суперкомпьютер работавший на MacOS выбыл из списка.