Проблемы, обозначенные за последнюю неделю в отношениях России и Киргизии, не могут не отразиться как на реализации в этой республике крупных инфраструктурных проектов с российским участием, так и на геоэкономической конфигурации постсоветского пространства в целом. Выступая 12 февраля на совещании по энергетике в Омске, президент России Д. Медведев заявил, что Киргизии и Таджикистану рассчитывать на присоединение к Таможенному союзу в ближайшее время не стоит. "Мы все решения по ЕЭП приняли и будем их реализовывать в те сроки, которые запланировали. Но это не значит, что мы собираемся затягивать искусственным образом в ЕЭП Киргизию и Таджикистан", — заметил Д.Медведев. К такому шагу, добавил российский президент, эти страны «пока не очень готовы».

Поясняя свои слова, Д. Медведев подчеркнул: «Это наши партнеры, но это не значит, что мы должны предоставлять им необоснованные преференции. Да, ЕЭП — это Белоруссия и Казахстан. По остальным странам вы предоставьте уж мне это право, я буду определяться в зависимости от поведения руководства этих государств». Причем «по некоторым из этих стран у нас есть вопросы». То, что к Бишкеку у Москвы появились серьёзные претензии, стало ясно уже через несколько дней после выступления Д.Медведева в Омске.

17 февраля первый секретарь посольства РФ в Бишкеке Виталий Скринник в интервью американскому интернет-изданию «EurasiaNet» заявил, что Киргизия использовала не по назначению средства, предоставленные Россией в качестве льготного кредита. Эти деньги использованы для создания фонда кредитования с целью извлечения коммерческой прибыли. По его словам, «здесь мы имеем дело с нецелевым использованием… 450 млн. долларов». При этом к получению ещё одного кредита в размере 1,7 млрд. долл., предназначенного для строительства Камбаратинской ГЭС-1, Киргизия пока не готова, так как сначала должна «создать структуру и разработать программу по этому кредиту», а это до сих пор не сделано.

Соглашения о предоставлении Киргизии российских кредитов были подписаны 3 февраля 2009 г. в Москв