Юрист фонда Hermitage Сергей Магнитский, скончавшийся в московском СИЗО в ноябре 2009 года, принимал непосредственное участие в хищении 5,4 миллиарда рублей из госбюджета. Об этом, как сообщается на сайте газеты "Коммерсант", заявил арестованный гендиректор ООО "Махаон", через которое и были похищены средства.
По данным издания, гендиректор ООО "Махаон" Вячеслав Хлебников был задержан и арестован в сентябре 2010 года. Он рассказал, что хищение бюджетных средств организовали должностные лица фонда, причем Магнитский был одним из основных участников аферы. Именно он, утверждает Хлебников, изготовил заведомо ложные налоговые декларации для осуществления налогового возврата.

Между тем часть похищенного уже обнаружена. Источник "Коммерсанта", знакомый с ходом расследования мошенничества, сообщил, что 685 миллионов рублей, переведенных со счета ООО "Махаон", нашли на корсчете лишенного лицензии КБ "Крайний Север". Эти средства арестованы судом.

Комментируя версию об участии Магнитского в афере, представители Hermitage заявили, что сотрудники милиции, причастные к хищению бюджетных денег, соорудили себе "чудовищное и циничное алиби", пользуясь покровительством руководства МВД РФ и "опьянев от чувства безнаказанности".