«Неверно были подключены датчики угловой скорости. При их подсоединении были перепутаны полюса», — сообщил близкий к комиссии источник. Эти приборы должны были определять смещение ракеты относительно ее нормального положения, однако из-за ошибки давали заведомо ложную информацию.

Версия о неправильной работе системы управления высказывалась неофициальными источниками практически сразу после видеотрансляции, шедшей в прямом эфире с места запуска. На сбой в управлении ракетой указывал ее наклон в первые секунды после старта, а также закручивание вдоль продольной оси.

5 июля глава Роскосмоса со ссылкой на материалы комиссии добавил, что ракета стартовала на 0,4 секунды раньше срока, а давление в камерах сгорания первой ступени было существенно ниже положенного: 90 вместо 150 атмосфер. Как эти факты согласуются с ошибкой, которая затрагивает только систему управления, источник «Интерфакс-АВН» не пояснил, однако добавил, что «неправильное подключение датчиков должны были обнаружить при комплексной проверке ракеты-носителя на заводе и на Байконуре». Кроме того, по информации собеседника агентства, рассматривались (и были отвергнуты) версии о поломке в двигателях первой ступени и отказе оборудования стартового комплекса.

Предыдущей версией аварии, о которой со ссылкой на анонимные источники сообщали информационные агентства, был отказ топливопровода в двигателе первой ступени.

Авария 2 июля привела к потере трех спутников «Глонасс-М»: ракета упала на землю через тридцать секунд после старта и взорвалась, оставив воронку диаметром около полусотни метров. Жертв и пострадавших в результате аварии не было, сооружения стартового комплекса не пострадали.